Desde agosto de 2020, el club había iniciado un reclamo ante la Federación por el reiterado incumplimiento de las normas económicas de Carlos Stein ( 17º con 27 puntos).

Sin embargo, esto fue desestimado por la Federación Peruana de Fútbol; recién en enero de 2021, Alianza Lima organizó su defensa frente a esa resolución injusta y antes que quede consentida, interpuso su recurso de apelación contra la resolución N°003-TCL-2021 del 27 de enero de 2021, ante el Tribunal de Arbitraje Deportivo – TAS, con un equipo multidisciplinario de abogados y peritos, comandado por el abogado César Torres, quien según señala el diario EL COMERCIO de Lima, asumió el riesgo de este proceso que culminó con la resolución favorable del TAS en el proceso signado como 2021/A/7672, devolviendo a Alianza Lima a Primera División para el inicio del campeonato 2021. En la temporada 2021 empezó con buen pie en el Torneo Apertura quedando tercero en su grupo tan solo perdiendo un partido, más tarde en el Torneo Clausura consiguió varios triunfos y unos cuantos empates, quedando primero en esa segunda fase, demostrando su nueva mejora y buen fútbol, Por el momento está en la tabla acumulada con 43 puntos.